Эндоскопия – это способ осмотра полостей организма животного с помощью эндоскопического оборудования которое вводится через естественные отверстия организма.
• Трахеобронхоскопия – осмотр трахеи и бронхов;
• Цистоскопия – осмотр мочевого пузыря;
• Уретроскопия – осмотр уретры;
• Вагиноскопия – осмотр влагалища;
• Гистероскопия – осмотр матки
• Отоскопия – осмотр наружного слухового прохода и       среднего уха;
• Риноскопия – осмотр носовых ходов и носоглотки;
• Ларингоскопия – осмотр структур гортани
• Эзофагоскопия – осмотр пищевода;
• Гастроскопия –    осмотр желудка;
• Дуоденоскопия – осмотр двенадцатиперстной кишки;
• Колоноскопия – осмотр толстой кишки;

Кроме осмотра и оценки состояния слизистой при эндоскопическом исследовании может проводиться забор материала для лабораторных исследований (гистологическое, цитологическое, бак посев, исследование на вирусные инфекции и др.). Через небольшие проколы проводят осмотр брюшной полости (лапароскопия), грудной полости (торакоскопия), а также суставов (артроскопия).